他的一生，经历了清朝、民国和中华人民共和国几个历史时期，曲折复杂，成就巨大。他一生笔耕不辍，著述等身，著有专著20多部、论文数百篇、诗词5000首。特别是对逻辑学和柳宗元文章的研究及其《逻辑指要》、《柳文指要》二书，在现代思想文化史上具有显著地位。

他对逻辑学有独到见解和深刻造诣。早年在《国风报》发表《论翻译名义》一文，第一次提出将西方“Logic”直接音译为“逻辑”，修改了过去译 为“名学”、“辩学”、“论理学”的概念表达方式，为学术界所接受，开中国逻辑学研究之先河。《逻辑指要》一书“以欧洲逻辑为经，本邦名理为纬”，运用西 方形式逻辑框架，阐述中国古代逻辑思想，驳斥了中国无逻辑的偏见，在中国逻辑学研究上是一件大事。毛泽东读后动员他修订再版，并写了“出版说明”，于 1961年再版发行，并因其学术价值高而收入《逻辑丛书》。

他的《柳文指要》也是在毛泽东鼓励下写成的。从1960年开始写作，成稿上下两卷100万字。毛泽东多次与他切磋、审改。两人都酷爱柳宗元的文 章，共同字斟句酌，传为柳文研究之佳话。该书在1971年终于问世。毛泽东不同意他书中反映出来的世界观，而对他歌颂柳宗元“以民为主”的思想和书中学术 见解，给予宽容和支持的态度，使之研习一生，晚年终就的巨著得以在90高龄时出版，足可慰藉了。

从1962年起，毛泽东每年以“还款”名义资助他2000元，直到他逝世为止。因为他是毛泽东的老师、又是毛泽东的岳父杨昌济先生的至交，而且 毛泽东早期革命活动得到过他的鼎力帮助，更因为他是中国共产党人的老朋友，因此，一直受到党和政府的礼遇和尊重。1958年3月30日，毛泽东曾幽默地 说：“章士钊这位老先生”，“抗战中一直同我党保持联系，建国后同我党合作，他自己说他‘反动而不反共’”。毛泽东多次与他合影留念。

1973年7月1日在香港病逝，终年92岁。周恩来派了专机在广州迎接骨灰，在北京参加追悼会时对其亲属说：“行老一生做了许多好事，他是中国共产党的一位好朋友。毛主席知道行老去世是很难过的，要我转达慰问。”